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Listar por autor "García-Nieto, José Manuel"
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A Multi-Objective Optimization Framework for Multiple Sequence Alignment with Metaheuristics
Zambrano-Vega, Cristian; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; García-Nieto, José Manuel; Aldana-Montes, José Francisco (2017-05-02)The alignment of more than two biological sequences is a widely used technique in a number of areas of computational biology. However, finding an optimal alignment has been shown to be an NP-complete optimization problem. ... -
A New Multi-Objective Approach for Molecular Docking Based on RMSD and Binding Energy
López-Camacho, Esteban; García Godoy, María Jesús; García-Nieto, José Manuel; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; Aldana-Montes, José Francisco (2016-07-12)Ligand-protein docking is an optimization problem based on predicting the position of a ligand with the lowest binding energy in the active site of the receptor. Molecular docking problems are traditionally tackled with ... -
A Semantic Model for Enhancing Data-Driven Open Banking Services
Paneque Romero, Manuel; Roldán-García, María del Mar; García-Nieto, José Manuel (IOAP-MDPI, 2023-01-21)In current Open Banking services, the European Payment Services Directive (PSD2) allows the secure collection of bank customer information, on their behalf and with their consent, to analyze their financial status and ... -
A Service for Flexible Management and Analysis of Heterogeneous Clinical Data
García-Nieto, José Manuel; Navas-Delgado, Ismael; Hurtado-Requena, Sandro José (Springer, 2022-06-08)Este documento describe FIMED 2.0, un servicio para la gestión flexible y análisis de datos clínicos heterogéneos. Esta herramienta de software permite la gestión flexible de datos clínicos de múltiples ensayos, lo que ... -
A Study of Archiving Strategies in Multi-Objective PSO for Molecular Docking
García-Nieto, José Manuel; López-Camacho, Esteban; García Godoy, María Jesús; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; Durillo, Juan J.; Aldana-Montes, José Francisco[et al.] (2016-09-30)Molecular docking is a complex optimization problem aimed at predicting the position of a ligand molecule in the active site of a receptor with the lowest binding energy. This problem can be formulated as a bi-objective ... -
About Designing an Observer Pattern-Based Architecture for a Multi-objective Metaheuristic Optimization Framework
Benítez-Hidalgo, Antonio; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; Durillo, Juan J.; García-Nieto, José Manuel; López-Camacho, Esteban; Barba-González, Cristóbal; Aldana-Montes, José Francisco[et al.] (2018-11-05)Multi-objective optimization with metaheuristics is an active and popular research field which is supported by the availability of software frameworks providing algorithms, benchmark problems, quality indicators and other ... -
Algoritmo Evolutivo Multi-Objectivo para la Toma de Decisiones Interactiva en Optimización Dinámica
Barba-González, Cristóbal; García-Nieto, José Manuel; Ruiz-Mora, Ana Belén; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; Luque-Gallego, Mariano; Aldana-Montes, José Francisco[et al.] (2018-11-09)Debido al creciente interés en el análisis de datos en streaming en entornos Big Data para la toma de decisiones, cada vez es más común la aparición de problemas de optimización dinámica que involucran dos o más objetivos ... -
Análisis supervisado de imágenes aéreas usando técnicas de aprendizaje profundo aplicado a detección de cultivos tropicales
Cardas Ezeiza, Cristian (2020-11-10)En la actualidad, el enorme volumen de datos accesibles sobre diversas áreas de conocimiento y los modelos matemáticos, junto al poder de procesamiento de los computadores, están dando pie a numerosas aplicaciones que ... -
Aplicación de técnicas de Deep Learning al Alineamiento Múltiple de Secuencias
Piriz Sapio, Fiorella (2021)En la última década, Deep Learning (DL) ha sido una de las técnicas más em pleadas en diversos campos de estudio, incluida la Bioinformática. Sin embargo, a día de hoy no existen demasiados estudios en los que se aplique ... -
Artificial decision maker driven by PSO: an approach for testing reference point based interactive methods
Ojalehto, Vesa; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; Miettinen, Kaisa; Aldana-Montes, José Francisco; García-Nieto, José Manuel; Barba-González, Cristóbal[et al.] (2018-09-14)Over the years, many interactive multiobjective optimization methods based on a reference point have been proposed. With a reference point, the decision maker indicates desirable objective function values to iteratively ... -
Automatic configuration of NSGA-II with jMetal and irace
Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; López-Ibáñez, Manuel; Barba-González, Cristóbal; García-Nieto, José Manuel (ACM, 2019)jMetal is a Java-based framework for multi-objective optimization with metaheuristics providing, among other features, a wide set of algorithms that are representative of the state-of-the-art. Although it has become a ... -
Automatic frequency-based feature selection using discrete weighted evolution strategy
Nematzadeh, Hossein; García-Nieto, José Manuel; Navas-Delgado, Ismael; Aldana-Montes, José Francisco (Elsevier, 2022-10-10)High dimensional datasets usually suffer from curse of dimensionality which may increase the classification time and decrease the classification accuracy beyond a certain dimensionality. Thus, feature selection is used to ... -
Automatic tuning of communication protocols for vehicular ad hoc networks using metaheuristics.
Toutouh-el-Alamin, Jamal; García-Nieto, José Manuel; Alba-Torres, Enrique (Elsevier, 2010-08)The emerging field of vehicular ad hoc networks (VANETs) deals with a set of communicating vehicles which are able to spontaneously interconnect without any pre-existing infrastructure. In such kind of networks, it is ... -
Big Data Optimization : Algorithmic Framework for Data Analysis Guided by Semantics
Barba-González, Cristóbal (UMA Editorial, 2018-10-30)Over the past decade the rapid rise of creating data in all domains of knowledge such as traffic, medicine, social network, industry, etc., has highlighted the need for enhancing the process of analyzing large data volumes, ... -
Big Data Optimization: Framework Algorítmico para el análisis de Datos guiado por Semántica
En las últimas décadas el aumento de fuentes de información en diferentes campos de la sociedad desde la salud hasta las redes sociales, ha puesto de manifiesto la necesidad de nuevas técnicas para su análisis, lo que se ... -
Captura y gestión de open data en entornos de smart city
Fenna-Vílchez, Antonio (2017-01-19)Este trabajo va enfocado a la aplicación de Big Data en Smart Cities (Ciudades Inteligentes). Se pretende facilitar la gestión el tráfico de una ciudad y en este caso se ha escogido la ciudad de Santander. Santander dispone ... -
Coordinación de casos prácticos en asignaturas del área de conocimiento “Gestión de la Información” según modelo curricular de informática de la ACM/IEEE 2013
García-Nieto, José Manuel; Navas-Delgado, Ismael; Roldán-García, María del Mar; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; Gómez López, María Teresa; Bernárdez Jiménez, Beatriz; Aldana-Montes, José Francisco[et al.] (2017-07-04)Este artículo presenta el estado de desarrollo y resultados preliminares del proyecto de innovación docente de la Universidad de Málaga (PIE15-183): Coor-dinación de casos prácticos en asignaturas del área de conocimiento ... -
Desarrollo de aplicación web FIMED 2.0
Doblas Jiménez, Daniel (2021)FIMED nació ante la premisa de resolver los problemas que presentan los sistemas de gestión de ensayos clínicos. Estos problemas están relacionados con las limitaciones de diseño debido a la naturaleza de los datos clínicos. ... -
Docking Inter/Intra-Molecular Mediante Metaheurísticas Multi-objetivo
López-Camacho, Esteban; García Godoy, María Jesús; García-Nieto, José Manuel; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; Aldana-Montes, José Francisco (2015-02-11)El Acoplamiento Molecular (Molecular Docking) es un problema de optimización de gran complejidad que consiste en predecir la orientación de dos moléculas: el ligando y el receptor, de manera que formen un complejo molecular ... -
Dynamic Multi-Objective Optimization With jMetal and Spark: a Case Study
Cordero Benítez, José Andrés; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesús; Barba-González, Cristóbal; Durillo, Juan J.; García-Nieto, José Manuel; Navas-Delgado, Ismael; Aldana-Montes, José Francisco[et al.] (2016-09-15)Technologies for Big Data and Data Science are receiving increasing research interest nowadays. This paper introduces the prototyping architecture of a tool aimed to solve Big Data Optimization problems. Our tool combines ...